Specialistas, įgyvendindamas Skyriaus uždavinius, atlieka šias funkcijas:

• tvarko priskirtų programų apskaitą, sudaro apskaitos registrus, ruošia sąmatas, jų pakeitimus, rengia mėnesines, ketvirtines bei metines ataskaitas ir teikia Ekonominės analizės, finansų ir biudžeto skyriui;
• suveda į apskaitos programą gautų dokumentų, pagrindžiančių išlaidų sąnaudas, sąskaitų faktūrų duomenis, paskirstydamas pagal  valstybės funkcijas, ekonominę klasifikaciją ir lėšų šaltinius, ruošia sąmatas, jų keitimą, tvarko kasinių išlaidų apskaitą, ruošia F2 formas, teikia mokėjimo paraiškas lėšoms gauti savivaldybės  Ekonominės analizės, finansų ir biudžeto skyriui, parengia mokėjimų nurodymus, sudaro apskaitos registrus;
• vykdo Europos Sąjungos struktūrinių fondų finansines paramos apskaitą, tikrina banko sąskaitoje atliktų operacijų teisingumą, pildo mokėjimo paraiškas/prašymus teikiamus agentūroms;
• tvarko projektams ir programoms atidarytas  banko sąskaitas,   pinigų srautų apskaitą, sudaro apskaitos registrus;
• sudaro mokėtinų ir gautinų sumų mėnesinę ataskaitą  pagal programas, valstybės funkcijas, ekonominę klasifikaciją ir lėšų šaltinius;
• pildo apskaitos registrus, reikalingus Didžiosios knygos, Finansinės būklės ir Veiklos rezultatų ataskaitoms pagal priskirtas funkcijas, sistemina ir teikia informaciją nurodytais terminais;
• pagal programas pateikia informaciją finansinių ataskaitų rinkinio sudarymui ir tarpusavio derinimo operacijoms su viešojo sektoriaus subjektais dėl duomenų pateikimo į VSAKIS programą;
• vykdo einamąją finansų kontrolę pagal administracijos direktoriaus įsakymu nustatytas finansų kontrolės taisykles;
• sudaro  statistines ataskaitas;
• pagal kompetenciją dalyvauja komisijų, darbo grupių darbe;
• pavaduoja skyriaus darbuotojus jiems nesant;
• atlieka kitus su pareigybės funkcijoms susijusius nenuolatinio pobūdžio skyriaus vedėjo pavedimus tam, kad būtų įgyvendinti skyriaus uždaviniai.